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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
從人心臟cDNA文庫(kù)中篩選出與CVB3 VP3蛋白相互作用的人細(xì)胞蛋白。
方法:
1.采用PCR技術(shù)擴(kuò)增出VP3基因,將其插入到真核表達(dá)質(zhì)粒pGBKT7中構(gòu)建重組誘餌質(zhì)粒pGBKT7-VP3;
2.采用乙酸鋰法將pGBKT7-VP3轉(zhuǎn)化至酵母菌AH109中,通過(guò)表型鑒定、PCR法驗(yàn)證質(zhì)粒pGBKT7-VP3是否轉(zhuǎn)化至酵母菌中;
3.利用Western blot檢測(cè)酵母菌AH109
2、[pGBKT7-VP3]中VP3蛋白的表達(dá);
4.利用營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基以及酶底物X-α-Gal的變化情況檢測(cè)VP3基因?qū)?bào)告基因(HIS3、ADE2和MEL1)的轉(zhuǎn)錄自激活作用;
5.經(jīng)小規(guī)模配合試驗(yàn)檢測(cè)VP3蛋白對(duì)酵母菌配合功能的影響;
6.利用大規(guī)模酵母配合實(shí)驗(yàn)篩選人心臟cDNA文庫(kù);
7.經(jīng)陽(yáng)性克隆的表型確定、PCR擴(kuò)增cDNA插入片段和Alu I酶切等試驗(yàn)將陽(yáng)性克隆歸類,并進(jìn)行測(cè)序和同源性比
3、對(duì)分析;
8.采用α-半乳糖苷酶定量分析VP3蛋白與各陽(yáng)性蛋白之間相互作用的強(qiáng)弱;
9.利用營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基以及酶底物X-α-Gal的變化情況檢測(cè)陽(yáng)性文庫(kù)質(zhì)粒pGADT7-ADx對(duì)報(bào)告基因(HIS3、ADE2和MEL1)的轉(zhuǎn)錄自激活作用;
10.利用回返配合試驗(yàn)對(duì)篩出的各陽(yáng)性蛋白與VP3蛋白的相互作用再次進(jìn)行驗(yàn)證。
結(jié)果:
1.雙酶切及序列分析提示VP3基因已成功插入pGBKT7載體的多克
4、隆位點(diǎn),并且閱讀框與病毒VP3基因一致;
2.表型鑒定和PCR法驗(yàn)證pGBKT7-VP3質(zhì)粒已成功轉(zhuǎn)入酵母菌AH109中;
3. Western blot證實(shí)酵母菌AH109[pGBKT7-VP3]能表達(dá)VP3蛋白;
4.營(yíng)養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基和酶底物X-α-Gal變化情況顯示VP3蛋白對(duì)報(bào)告基因無(wú)轉(zhuǎn)錄自激活作用;
5.小規(guī)模配合試驗(yàn)表明VP3蛋白在AH109的表達(dá)基本不影響酵母菌正常的配合功能。
5、> 6.以CVB3 VP3為誘餌蛋白,從人心臟cDNA文庫(kù)中篩選到50個(gè)陽(yáng)性候選克隆;
7.經(jīng)陽(yáng)性候選克隆的初步分析將陽(yáng)性克隆歸為10類,并經(jīng)測(cè)序和同源性比對(duì),最后共獲得10種不同類別的陽(yáng)性蛋白:線粒體乙醛脫氫酶2(ALDH2)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體中間室蛋白1( ERGIC1)、真核翻譯起始因子4A2(EIF4A2)、肌鈣蛋白I3型(TNNI3)、平滑肌蛋白3(LMOD3)、羥酰輔酶 A脫氫酶三官能蛋白轉(zhuǎn)錄變體3( HADHB
6、)、門冬酰胺酶同系物(ASPG)、3-磷酸甘油醛脫氫酶(GAPDH)、肌肉型肌酸激酶(CKM)、骨骼肌α1肌動(dòng)蛋白(ACTA1)。
8.α-半乳糖苷酶定量試驗(yàn)進(jìn)一步證明了篩選出的10種陽(yáng)性蛋白與VP3蛋白均有較強(qiáng)的相互作用;
9.篩選出的10種陽(yáng)性蛋白對(duì)報(bào)告基因無(wú)轉(zhuǎn)錄自激活作用;
10.回返配合試驗(yàn)再次驗(yàn)證10種陽(yáng)性蛋白與VP3蛋白存在相互作用。
結(jié)論:
1.成功構(gòu)建了重組質(zhì)粒pGBKT
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