基于功能網絡的microRNA與疾病關聯(lián)預測方法研究.pdf

1、本文主要研究疾病與miRNA的關聯(lián)預測。為了讓生物學家提高發(fā)現(xiàn)疾病與miRNA更新的關聯(lián)，我們對miRNA功能相似性計算、相似性的并行計算、人類疾病關聯(lián)miRNA預測等問題進行了深入的研究，提高了對任意給定疾病的可能miRNA候選的預測準確性。主要包括以下三方面的內容:
　　(1)研究了疾病術語語義相似性、miRNA功能相似性的并行計算方法。目前的疾病術語語義相似性、miRNA功能相似性計算方法耗時較長。我們在研究新的相似性計算方

2、法時，在每次改變計算策略后，需要較長時間等待實驗結果。為了加快相似性的計算，本文提出了基于MapReduce的疾病術語相似性、miRNA功能相似性的并行計算方法。對比串行算法，我們將相似性計算時間降低到可接受的范圍內，并且單個節(jié)點運行該算法也有一定的加速效果。
　　(2)研究了miRNA功能相似性的計算方法。本文提出了一種基于分組比較的miRNA功能相似性計算方法。通過去除同組內部的疾病術語間的重疊信息，使用比較兩組疾病術語的信息

3、含量的方法來計算miRNA間的功能相似性。與現(xiàn)有的方法比，本文的方法計算出的同家族及同分簇的miRNA間功能相似性具有更高相似性的特點，符合生物前提。本文提出的miRNA功能相似性計算方法在3種疾病miRNA關聯(lián)預測方法上均表現(xiàn)出比其他miRNA功能相似性方法更高的預測性能。
　　(3)研究了疾病miNRA關聯(lián)預測方法。本文利用每個miRNA作為起點，在使用miRNA功能相似性構建的miRNA功能網絡上獨立進行有重啟的隨機游走，根