功能基因芯片(GeoChip)在兩種典型環(huán)境微生物群落分析中應(yīng)用的研究.pdf_第1頁(yè)
已閱讀1頁(yè),還剩121頁(yè)未讀 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

1、微生物在自然界無(wú)處不在,而且其參與并承擔(dān)著重要的生態(tài)功能,從碳、氮循環(huán),到礦物形成和風(fēng)化,無(wú)一不與微生物相關(guān)。但是,目前,自然界約99%的微生物因有限的培養(yǎng)基和特異的生長(zhǎng)條件而尚未被培養(yǎng),因此如何準(zhǔn)確描述和定量自然環(huán)境中的微生物群落及其同環(huán)境因素之間的關(guān)系,是環(huán)境微生物生態(tài)學(xué)的重要研究課題之一。本研究主要以功能基因芯片(GeoChip)在環(huán)境微生物群落分析中應(yīng)用為研究主線(xiàn),分別從環(huán)境樣品DNA的提取與純化和GeoChip在兩種典型環(huán)境微

2、生物群落分析中的應(yīng)用為支線(xiàn),對(duì)GeoChip在環(huán)境微生物群落分析中的應(yīng)用展開(kāi)了一系列的具體研究與探討。除了GeoChip技術(shù),本研究還采用了其他諸如克隆文庫(kù)、BIOLOG、PLFA和土壤呼吸儀等技術(shù)手段作為輔助手段,對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行了全面的分析與研究。
   本研究的主要結(jié)果如下:第一,經(jīng)過(guò)136個(gè)土壤樣品的純化測(cè)試表明,本研究改進(jìn)后的低融點(diǎn)膠純化環(huán)境樣品DNA的方法,可以從各種污染程度的環(huán)境樣品中獲得高質(zhì)量、大片段(>23 kb

3、)的DNA,且均能夠用于全基因組放大、標(biāo)記和雜交;第二,來(lái)自三座銅礦山的酸性礦坑水(acid mine drainage,AMD)中的微生物群落結(jié)構(gòu)相對(duì)較簡(jiǎn)單,且不同AMD樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)差異較大,其中的微生物主要由α-,β-和γ-Proteobacteria,Acidobacteria,Actinobacteria,Cyano-bacteria,F(xiàn)irmicutes,Proteobacteria,Planctomycetes,Ba

4、cteriodetes和Nitrospirae組成;雖然GeoChip2.0芯片從AMD生態(tài)系統(tǒng)中檢測(cè)到較少的功能基因,但檢測(cè)到的功能基因幾乎涉及到所有的基本生物地球化學(xué)循環(huán)過(guò)程,而且,多元統(tǒng)計(jì)分析表明,AMD中的微生物群落組成主要受周?chē)h(huán)境地化參量的影響;第三,GeoChip檢測(cè)到氣候變暖的加溫效應(yīng)導(dǎo)致地表微生物群落功能基因的豐度增加,土壤微生物的群落結(jié)構(gòu)受到了顯著的影響,而采割處理(用來(lái)模仿收獲地表植被生物量,并用于生物能源)增強(qiáng)了

5、加溫處理導(dǎo)致的溫度增加作用,但降低了微生物群落的分散度(結(jié)構(gòu),多樣性,豐度)和功能基因(碳,氮,磷,硫循環(huán)基因)的豐度,差異分解分析表明,除土壤溫度以外,土壤和植物變量可以解釋79.4%的總變異,表明土壤溫度升高通過(guò)影響土壤和植物變量而影響土壤中微生物群落結(jié)構(gòu)的。
   總而言之,通過(guò)GeoChip對(duì)兩種典型環(huán)境(極端酸性水環(huán)境和氣候變暖下的土壤環(huán)境)中微生物的群落結(jié)構(gòu)的研究,我們認(rèn)為,GeoChip作為一種宏基因組學(xué)研究技術(shù),

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論