玉米自交系遺傳多樣性及產量性狀與SSR標記的關聯分析.pdf

1、玉米是世界上重要的谷類作物之一，在食品和工業(yè)中具有廣泛用途。我國玉米種植分布范圍廣泛但不均勻。研究玉米自交系的遺傳多樣性，確定其親緣關系遠近，可為玉米的新品種選育工作提供依據。同時高產是玉米育種的首要目標，玉米產量性狀的遺傳改良是其遺傳育種研究的熱點之一。本研究以172個玉米自交系為供試材料，利用分布在玉米10條染色體上的的115對SSR標記對供試材料的遺傳多樣性進行了分析。同時在分析供試自交系群體結構和連鎖不平衡的基礎上，利用關聯分析

2、方法對供試材料的10個產量相關性狀與SSR標記進行了分析。從而為玉米自交系的進一步改良提供依據。研究結果如下:
　　 (1)選用115對均勻分布于玉米10條染色體上的SSR引物，在所有供試材料中共檢測出644個等位差異片段，單個引物擴增的差異片段變化范圍為2-15個，每對引物平均檢測出5.6個。所有標記位點的PIC平均值為0.59，單個引物PIC值的變化范圍為0.18-0.91。所有位點基因多樣性的變化范圍為0.20-0.92，

3、平均值為0.64。其中umc1880的PIC值和基因多樣性值最高，分別0.91和0.92。
　　 (2)基于群體混合模型進行群體結構分析172份玉米自交系可分為5個亞群，運用PowerMarker3.0軟件計算個亞群間的Nei's遺傳距離。結果發(fā)現亞群二與亞群五之間的遺傳距離為0.3981，為最大值。由此看出我國地方玉米品種與起源于熱帶地區(qū)的玉米品種親緣關系較遠。
　　 (3)玉米115個SSR位點的6555種兩兩組合中

4、，無論是線性的組合還是非線性的組合，均存在一定的連鎖不平衡現象。其中基于統(tǒng)計概率(p＜0.01)的不平衡位點占總位點組合數的64.30％，測驗概率達到0.001顯著水平的位點有51.80％;而不平衡程度D’＞0.5的組合數占總位點數的1.08％。對于整個群體，LD在遺傳距離＜400cM普遍存在。
　　 (4)基于群體結構的關聯分析檢測與10個產量性狀相關聯的SSR標記達21個，總位點數為42個;其中與穗重相關聯的位點有7個，解釋

5、表型變異率最高的為phi420701(0.37)，與穗長、禿尖長、穗粗、軸粗關聯的位點均為3個，而與穗行數相關聯的位點有4個，累計解釋貢獻率43％;與行粒數和粒重相關聯的位點都為5個;與出籽率相關聯的位點只有一個，表型解釋變異率為0.08;10個產量性狀中與百粒重相關聯的位點最多，累計解釋貢獻率為53％。同一位點與多個農藝性狀相關聯的情況普遍存在，位于8號染色體的標記phi420701與7個產量性狀相關聯，表型解釋貢獻率均大于10％，而