基于基因檢測比對的實驗室信息管理系統(tǒng)設計研究

1、基于基因檢測比對的實驗信息管理系統(tǒng)設計研究摘要實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)將實驗室的儀器設備、檢驗各環(huán)節(jié)中涉及的人員和部門通過計算機網絡連起來，采用科學的管理思想和先進的數據庫技術，實現(xiàn)以實驗室為核心的整體環(huán)境的全方位管理。目前，有許多單獨的實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)單獨對數據庫進行管理。但是，高效管理的LIMS系統(tǒng)能夠管理實驗信息的仍然較少。為了滿足這些需要，我們設計了這個LIMS系統(tǒng)來嘗試更加高效的管理信息。本文中研究的系統(tǒng)集

2、樣品管理，資源管理，事務管理，質量控制，網絡管理，數據管理圈∈集、傳輸、處理、輸出、發(fā)布)，報表管理等諸多模塊為一體，組成一套完整的實驗室綜合管理和產品質量監(jiān)控體系，是驗室的軟件工作平臺。系統(tǒng)既能滿足日常檢驗、數據分析和技術管理耍求，又能保證實驗室數據庫建設的嚴格管理、控制。系統(tǒng)的開發(fā)主要是在實現(xiàn)基本用戶、系統(tǒng)等管理的同時，使用GeneMapper處理生成的數據表，以及使用EntityFramework抽象化數據結構的方式，將每個數據庫

3、對象都轉換成應用程序對象(entity)，而數據字段都轉換為屬性(property)，關系則轉換為結合屬性(association)，方便了程序員等對數據庫的操作，實現(xiàn)基因的匹配計算，繪制出基因圖譜。實現(xiàn)從實驗的委托到檢驗再到分析結果的一系列操作，使實驗步驟更加規(guī)范化，盡量避免人為失誤的產生，建立起一個犯罪DNA數據庫。關鍵字：LIMS、基因比對、EntityFramework、數據庫萬方數據基于基因檢測比對的實驗信息管理系統(tǒng)設計研究目

4、錄摘要1ABSTRACT：2目錄3第一章緒論511課題的背景及意義5111課題背景5112課題意義612犯罪DNA數據庫實驗室管理系統(tǒng)的應用現(xiàn)狀713擬解決的關鍵問題814課題的研究方法、設計以及實驗方案8第二章LIMS知識簡介921實驗窒信息管理系統(tǒng)的基本概念922實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的發(fā)展歷史10221LIMS發(fā)展至今大體可分為以下幾個階段lO222LIMS發(fā)展歷程(以主要產品為代表)1023傳統(tǒng)實驗室信息管理系統(tǒng)(LIM

5、S)的基本基本運行環(huán)境以及系統(tǒng)的網絡結構10231基本運行環(huán)境10231系統(tǒng)的網絡結構1124設計開發(fā)實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的目的11241規(guī)范實驗室內部管理一1124。2實現(xiàn)質量數據大范圍共享1l2。5傳統(tǒng)實驗室信息管理系統(tǒng)(uMS)的介紹12251管理模塊12252查詢統(tǒng)計模塊1226傳統(tǒng)實驗室信息管理系統(tǒng)(uMs)的開放式架構1327實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的系統(tǒng)設計原則，13271實驗室網絡系統(tǒng)構架一132。7，2

6、系統(tǒng)權限管理構架一14273分析儀器設備的數據合理整合系統(tǒng)14274以分析測試工作為核心的網絡管理體系14275實驗室其他管理信息體系模塊1428本章小結14第三章基于DNA項目的LIMS設計開發(fā)相關背景知識。1631背景知識16311ORM的選型16312EntityFramework與WCF的比較，17313EntityFramework與NHibemate的比較1732基因相似度匹配1833系統(tǒng)設計中的設計模式使用18331設計模