大腸癌組織、腺瘤組織和正常黏膜組織的基因表達(dá)譜分析.pdf

1、目的：本研究的主要目的是通過(guò)建立具有組織特異性的大腸癌基因表達(dá)譜，從轉(zhuǎn)錄組整體水平尋找大腸腫瘤組織、腺瘤組織與正常組織之間的基因表達(dá)模式差異，發(fā)現(xiàn)用于預(yù)防和早期檢測(cè)的候選分子標(biāo)志物以及基因治療的可能靶點(diǎn)。 方法：利用包含47，000個(gè)轉(zhuǎn)錄本及變異體的AffymetrixU133plus2.0全基因組芯片篩選大腸癌組織、腺瘤組織與正常組織之間差異表達(dá)基因；運(yùn)用生物信息學(xué)手段對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行功能分類，以發(fā)現(xiàn)在大腸癌的發(fā)生中起重要作

2、用的基因。 結(jié)果：1、篩得大腸癌相關(guān)基因和ESTs2340個(gè)(占基因和ESTs總數(shù)的4.28％)，其中：大腸癌組表達(dá)上調(diào)者609個(gè)(占基因和ESTs總數(shù)的1.12％)；大腸癌組表達(dá)下調(diào)者1731個(gè)(占基因和ESTs總數(shù)的3.16％) 2、篩得早期大腸癌相關(guān)基因和ESTs726個(gè)(占基因和ESTs總數(shù)的1.32％)，其中：大腸癌組與腺瘤組共同表達(dá)上調(diào)者133個(gè)(占基因和ESTs總數(shù)的0.24％)；大腸癌組與腺瘤組共同表達(dá)下

3、調(diào)者593個(gè)(占基因和ESTs總數(shù)的1.08％) 3、對(duì)篩得之大腸癌相關(guān)基因和早期大腸癌相關(guān)基因進(jìn)行了功能分類，得到所參與基因的分子功能及生物學(xué)過(guò)程 大腸癌相關(guān)基因所參與的功能類別包括細(xì)胞生長(zhǎng)和/或維持、對(duì)外刺激反應(yīng)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫應(yīng)答、蛋白質(zhì)代謝、堿基、核苷、核苷酸和核酸代謝等 早期大腸癌相關(guān)基因所參與的功能類別包括細(xì)胞生長(zhǎng)和/或維持、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)代謝、對(duì)外刺激反應(yīng)、堿基、核苷、核苷酸和核酸代謝、生物合成等

4、 大腸癌相關(guān)基因和早期大腸癌相關(guān)基因中，參與細(xì)胞生長(zhǎng)和/或維持功能的基因占參與分類基因的比例最大，為最大的一組功能基因 4、篩選出5個(gè)在腺瘤組織及腫瘤組織中都升高表達(dá)8倍以上的基因(CADPS，F(xiàn)ABP6，LCN2，CHRM3，CLDN2)，其編碼產(chǎn)物為分泌性蛋白或膜表面蛋白，作為早期檢測(cè)的候選分子標(biāo)志物以及基因治療的可能靶點(diǎn) 結(jié)論：在大腸癌發(fā)生的早期階段就有多個(gè)基因表達(dá)的異常開(kāi)啟(活化)或關(guān)閉(失活)，通過(guò)所編