轉錄因子和染色質特征的分布特點及其關聯(lián).pdf

1、基因表達的調控涉及轉錄因子、組蛋白修飾和其他因素之間復雜的相互作用。轉錄因子和表觀遺傳修飾共同調節(jié)基因的表達，并在其中起到重要的作用，同時有研究表明，轉錄因子和表觀遺傳修飾之間有著密切聯(lián)系。表觀遺傳修飾和轉錄因子之間的研究表明染色質中的某些因素作用于轉錄因子附近或轉錄起始位置;染色質特性與共占有轉錄因子的研究依然還是受到許多因素限制，目前有很多種計算方法來衡量染色質特征與轉錄因子之間的相關性來鑒定轉錄因子共占位點，但每種方法都有不同缺陷

2、。本文選擇兩個人類細胞系，分別是來自ENCODE數(shù)據(jù)的人類胚胎干細胞和人類宮頸癌細胞，包括單獨轉錄因子和共占有轉錄因子共80個，研究不同的染色質特征與轉錄因子的關系。首次提出chromatin state特征，結合染色質特征包括DNaseⅠ、11種組蛋白修飾、DNA甲基化，利用統(tǒng)計分析的方法預測共占有轉錄因子，發(fā)現(xiàn)H3K27ac、H3K4me2、H3K4me3和H3K9ac是更可靠的預測因子，融合DNA甲基化可以把預測準確率提高2％左右