基于基因表達譜數(shù)據(jù)的癌癥分類研究.pdf

1、癌癥種類繁多、致病機理復(fù)雜而且難以治愈，近年已經(jīng)嚴重危害到人類的生命和健康。盡早的確診可以幫助挽救病人生命，由于傳統(tǒng)癌癥診斷方法自身的局限性，并沒有很好的解決這一問題?；蛐酒?，又稱作DNA微陣列，是上世紀(jì)以來生物信息學(xué)領(lǐng)域的一個重大技術(shù)突破，其高通量特點使得在單次實驗中同時檢測大量基因的表達值成為可能。此后，基因芯片就作為分子生物學(xué)研究中的一個重要的基本工具，被廣泛用于癌癥的診斷和類型識別中。利用基因表達譜數(shù)據(jù)得以對癌癥分類問題從分子

2、水平上進行分析和研究，目前基于基因表達譜的癌癥分類研究主要集中在兩個方面:一來，基因表達譜數(shù)據(jù)擁有高維小樣本、高冗余、高噪音等特點，如何從這些數(shù)據(jù)中選擇出于疾病相關(guān)的基因成為了研究重點;二來，當(dāng)前基因表達譜數(shù)據(jù)分析的成熟度并沒有達到應(yīng)用水平，目前癌癥診斷仍依賴于傳統(tǒng)基于形態(tài)學(xué)的方法，所以尋找到高效的分類算法提高分類性能是研究的另一個關(guān)鍵任務(wù)。
　　針對上述兩個方面，本文參考了大量相關(guān)文獻，了解了癌癥分類問題一般過程和常用方法，并展

3、開了如下工作:
　　(1)概述了集成學(xué)習(xí)的概念并提出一種基于數(shù)據(jù)自身的集成分類的設(shè)想，在一個已有的集成分類方法上提出了一種叫單點定界的集成分類算法(SPEC)的改進方方法，該方法應(yīng)用了一個新穎的策略，在基因選擇的同時解析了集成分類的規(guī)則。并在急性白血病和結(jié)腸癌數(shù)據(jù)集上展開了測試實驗，以很少的時間和空間資源得到了令人滿意的分類效果，證明了方法的不僅實現(xiàn)簡單而且十分有效;
　　(2)分析了單點定界方法的不足和局限性，分別給出了改